W I rundzie rozgrywek zagrają:

Kotwica Kołobrzeg – AZS Koszalin

Jezioro Tarnobrzeg – Polpharma Starogard Gdański

Anwil Włocławek – Start Gdynia

Energa Czarni Słupsk – Rosa Radom

I runda zostanie rozegrana w terminach: 7-8 (środa-czwartek) i 14-15 listopada (środa-czwartek)

Rozstawienie II rundy rozgrywek:

Kotwica/AZS – Jezioro/Polpharma
Anwil/Start – Energa Czarni/Rosa

I runda zostanie rozegrana w terminach: 5-6 (środa-czwartek) i 12-13 grudnia (środa-czwartek)

W rozgrywkach fazy wstępnej bierze udział osiem drużyn Tauron Basket Ligi, które nie biorą udziału w rozgrywkach europejskich. Rozegrają dwie rundy systemem mecz i rewanż.
Dwie najlepsze drużyny fazy wstępnej Intermarché Basket Cup awansują do fazy centralnej, w której udział wezmą także ekipy wyłonione w rozgrywkach na szczeblu PZKosz oraz uczestnicy rozgrywek europejskich.

Finałowy turniej z udziałem czterech zespołów zostanie rozegrany w dniach 9-10 lutego 2013 roku. Gospodarz zostanie wyłoniony w grudniu.
Obrońcą pucharu jest drużyna Trefla Sopot.